Протокол распространяет действие положений Европейской рамочной конвенции и Дополнительного протокола к ней на сотрудничество административно-территориальных единиц, не граничащих между собой.

Согласно ст. 6 Протокола каждая договаривающаяся сторона должна при подписании Протокола или сдаче на хранение Генеральному секретарю Совета Европы документа о его ратификации, принятии или утверждении заявить, будет ли она применять положения ст. 4 и 5 Дополнительного протокола к Европейской рамочной конвенции либо только одной из них.

Ратификация протокола позволит не только включить в сферу действия Европейской рамочной конвенции все субъекты РФ (на данный момент Конвенция распространяется лишь на 49 приграничных субъектов), но и обозначить в российской правовой системе основные ориентиры в развитии правовой основы деятельности органов по межтерриториальному сотрудничеству, образованных удалёнными друг от друга административно-территориальными единицами.

В настоящее время Протокол подписан 23 государствами - членами Совета Европы, из них 15 стран его ратифицировали.