Чтобы вернуть средства, ошибочно перечисленные в бюджет сверх фактически удержанного НДФЛ, нужно подать заявление в налоговый орган
Письмо Федеральной налоговой службы от 19 октября 2011 г. № ЕД-3-3/3432@ “О перечислении налога”
Налоговые агенты обязаны правильно и своевременно рассчитывать, удерживать и перечислять налоги в бюджетную систему на соответствующие счета Федерального казначейства.
Не допускается уплачивать налог за счет средств налоговых агентов.
Ежемесячно перечисляемая в бюджет сумма, которая превышает НДФЛ, фактически удержанный из доходов физлиц, не является налогом. В подобном случае налоговому агенту следует подать в налоговый орган заявление о возврате средств, не являющихся НДФЛ и ошибочно перечисленных в бюджет.