Департамент ветеринарии администрации Магаданской области является органом исполнительной власти Магаданской области, обеспечивающим реализацию полномочий в области ветеринарии, полномочий Российской Федерации в области ветеринарии, переданных для исполнения Магаданской области, осуществляющим государственный региональный ветеринарный надзор.

Департамент является юридическим лицом, финансовое обеспечение выполнения функций которого осуществляется на основе бюджетной сметы, имеет печать с изображением Государственного герба Российской Федерации и со своим наименованием, а также необходимые для его деятельности иные печати, штампы и бланки.

Департамент возглавляет начальник Департамента, который назначается на должность губернатором по представлению федерального органа исполнительной власти в области нормативно-правового регулирования в ветеринарии и освобождается от должности губернатором с согласия федерального органа исполнительной власти в области нормативно-правового регулирования в ветеринарии либо по его представлению.