Утвержденным положением установлено, что объектами государственной экологической экспертизы регионального уровня являются проекты нормативно-технических и инструктивно-методических документов в области охраны окружающей среды; соответствующие проекты целевых программ области; материалы обоснования лицензий на осуществление отдельных видов деятельности и др. ГЭЭ является платной и финансируется за счет средств заказчика документации.
Положением закреплено, что экспертное подразделение в срок не более 7 дней со дня регистрации материалов уведомляет заказчика при соответствии представленных материалов установленным требованиям - о необходимости оплаты проведения экспертизы; при несоответствии материалов установленным требованиям - о сроках представления материалов в полном объеме. Начало срока проведения ГЭЭ устанавливается не позднее чем через 30 дней после получения документа, подтверждающего ее оплату. Срок проведения ГЭЭ определяется в зависимости от трудоемкости экспертных работ с учетом объема представленных на экспертизу материалов и составляет от 30 до 120 дней. Обеспечение проведения экспертизы и подготовка сводного заключения осуществляется руководителем и ответственным секретарём экспертной комиссии. При несогласии более одной трети списочного состава комиссии с выводами проекта сводного заключения, экспертной комиссией готовятся предложения о дальнейшем проведении ГЭЭ, в том числе о продлении срока ее проведения и о включении в состав экспертной комиссии дополнительных экспертов. В случае отрицательного заключения ГЭЭ заказчик вправе представить материалы на повторную ГЭЭ.