С 1 января 2016 года услуги по перевозке пассажиров и багажа железнодорожным транспортом общего пользования во внутригосударственном сообщении подлежат налогообложению НДС по ставке 10 процентов (подп. 7 п. 2 ст. 164 НК РФ, Федеральный закон от 29 декабря 2015 г. № 386-ФЗ "Об установлении коэффициента-дефлятора на 2016 год и о внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации"). Однако, это касается только билетной и плацкартной составляющих стоимости проездного документа. Остальные услуги (дополнительные сборы, пользование постельными принадлежностями и питание) подлежат налогообложению НДС по ставке 18 процентов.

Для принятия к вычету НДС по расходам на проезд командированных работников организации к месту служебной командировки и обратно, а также по пользованию ими постельными принадлежностями в поездах, необходимы документы с выделенной в них отдельной строкой суммой НДС. Однако такое выделение разных ставок НДС в отдельные позиции по разным услугам в проездных документах обеспечено только с 8 февраля 2016 года.

В связи с этим, разъяснено, что организации, которые отправляли в командировки своих сотрудников и пользовались при этом услугами железнодорожной перевозки пассажиров во внутригосударственном сообщении в период с 1 января по 8 февраля 2016 года смогут включить в состав налоговых вычетов суммы НДС исходя из справки, где указаны тарифы на комплекс сервисных услуг в вагонах поездах федеральной пассажирской компании (письмо ОАО "РЖД" от 16 февраля 2016 г. № ИСХ-2141/ЦБС).

Получить такую справку организации, которые оформляли проездные документы на командированных работников в указанный период, смогут в подразделении федеральной пассажирской компании, с которым у организации заключен договор на оформление проездных железнодорожных документов. А если билет приобретался физлицом самостоятельно с оплатой в билетной кассе, то в любом сервисном центре железнодорожного агентства. В этом случае справка предоставляется на платной основе.