Установлено, что Департамент природопользования и охраны окружающей среды является специально уполномоченным органом в сфере регулирования отношений недропользования, охраны атмосферного воздуха, охраны, воспроизводства и использования объектов животного мира и среды их обитания.
В связи с этим на Департамент возлагаются дополнительные функции. В частности, Департамент предоставляет права пользования участками недр, содержащими общераспространенные полезные ископаемые, принимает решения о предоставлении права пользования участками недр для сбора геологических коллекционных материалов, выдает лицензии на пользование участками недр, охотничьи билеты и т.д.