Даже если автомобиль стоит в гараже и не используется, транспортный налог нужно уплачивать

Письмо Департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина РФ от 31 августа 2011 г. N 03-05-06-04/269 О взимании транспортного налога вне зависимости от факта использования транспортного средства

Транспортный налог взимается вне зависимости от того, используется ли имущество, признаваемое объектом обложения. Он уплачивается лицами, на которых зарегистрирован транспорт.

Если транспорт снимается с регистрации в течение налогового периода, то налог исчисляется с учетом специального коэффициента. Последний определяется как отношение числа полных месяцев, в течение которых транспорт был зарегистрирован на налогоплательщика, к числу календарных месяцев в налоговом периоде. При этом месяцы регистрации и снятия с нее принимаются за полные.

Взимание налога прекращается с месяца, следующего за тем, в котором транспорт снят с учета.