Выпущены методические рекомендации по "геномному" наблюдению за штаммами COVID на территории страны

tampatra@hotmail.cом / Depositphotos.com

Санитарное ведомство выпустило рекомендации об основных принципах организации и проведения молекулярно-генетического мониторинга штаммов возбудителя COVID-19, циркулирующих на территории РФ, вместе с перечнем научных организаций и противочумных учреждений Роспотребнадзора, осуществляющих полногеномное и фрагментное (мультилокусное) секвенирование материала от больных новой коронавирусной инфекцией. Любопытно, что образцы из Москвы исследуются в ФБУН "ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора", а из Подмосковья – во ФБУН "Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии" Роспотребнадзора (Методические рекомендации MP 3.1.0272-22 (утв. Роспотребнадзором 10 января 2022 г.).

Рекомендации содержат:

• критерии забора биоматериалов (в частности, от инфицированных после прививки. От лиц с нетипичными проявлениями COVID, детей, повторно заболевших и других),
• указания по хранению взятых образцов и использованию лабораторного оборудования,
• требования к сопроводительной информации к образцам (через заполнение онлайн-формы в соответствии с инструкцией, представленной в приложение 2 к Рекомендациям, при обязательном заполнении Обязательства о неразглашении),
• требования к транспортировке,
• алгоритм дифференциации генетических вариантов вируса SARS-COV-2 (предложено ориентироваться на актуальный список вариантов, подлежащих исследованию, с указанием искомых мутаций, а также их распределения по амплифицируемым фрагментам из протоколов Университета Женевы и ARTIC v.3 с портала https://genome.crie.ru/),
• Перечень идентифицируемых генетических вариантов SARS-CoV-2 (в том числе – Omicron, В.1.1.529 ("Южно-Африканский")), с подробной информацией о характерных мутациях гена S, перечнем мутаций генетических вариантов вируса SARS-CoV-2, детектируемых при фрагментом секвенировании, а также иной специальной информации,
• инструкция по работе с программой genome.crie.ru.