Письмо Федеральной налоговой службы от 10 августа 2011 г. N АС-4-3/13016@ "О перечне документов, подтверждающих изготовление аптечными организациями лекарственных средств, и применения налоговой ставки налога на добавленную стоимость в размере 10 процентов при их реализации на территории Российской Федерации"

Реализация аптечными организациями лекарственных средств, в том числе фармацевтических субстанций, облагается НДС по ставке 10%.
Обязательное условие - наличие регистрационного удостоверения на конкретные наименования лекарственных средств, выданного в установленном порядке.
Пониженная ставка налога также может применяться к реализации лекарственных средств внутриаптечного изготовления.
В последнем случае средства должны изготавливаться по рецепту на лекарственные препараты или по требованию медорганизации.